福島県にあるアクアマリンふくしまは、日本一展示数の多い水族館であると、wikipediaにまとまっています。
(展示数は流動的であることに注意が必要です)
福島県のアクアマリンふくしまに続くのが、茨城のアクアワールド・大洗、東京の東京タワー水族館です。
水族館のランキングでは、日本一大きな水族館が名古屋港水族館日本一大きな水槽を持つ沖縄美ら海水族館日本一入場者数数が多い水族館も沖縄美ら海水族館日本一展示種類数の多い水族館は鳥羽水族館日本一標高が高い水族館は蓼科アミューズメント水族館です。

 

1位 アクアマリンふくしま 福島県 210,000点(約750種)
2位 アクアワールド・大洗 茨城県 68,000点(約580種)
3位 東京タワー水族館 東京都 50,000点(約900種)
4位 サンシャイン水族館 東京都 37,000点(約750種)
5位 鳥羽水族館 三重県 30,000点(約1200種)
5位 海遊館 大阪府 30,000点(約580種)